קרן פסיפס ישראלי פועלת על בסיס התנדבותי, ההוצאות התפעוליות של העמותה ממומנות ע"י תרומות ייעודיות.
הקרן מתנהלת בשקיפות מלאה ומדווחת לציבור התורמים מדי חודש על האנשים שנעזרו בכספם באמצעות דו"חות המועלים לאתר האינטרנט באופן שוטף.
התרומות אינן מועברות לחשבון הבנק של האדם הפונה, אלא ישירות לגוף דרכו האדם מבקש לממש את התרומה בכדי להבטיח כי התרומה תשמש להשגת המטרה לה ניתנה.

קרן פסיפס ישראלי הינה עמותה רשומה מס’ 58-046-170-5 ומוכרת כ”מוסד ציבורי” לעניין תרומות בארץ (סעיף 46) ומבטיחה קבלה מוכרת למס בארה”ב (501c3) ובקנדה בתרומות בכרטיס אשראי דרך טופס מאובטח.